first commit

2026-07-23 20:36:13 +08:00
commit 513b68be8c
7915 changed files with 2642530 additions and 0 deletions
@@ -0,0 +1,38 @@
+---
+title: 完整导出项目
+date: 2022-03-29 10:11:03
+excerpt: 利用python脚本一键导出所有项目相关资料。
+tags: []
+rating: ⭐⭐⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+要导出一个项目所有零碎的文件不是件容易的事儿，但是在本模板库中它就是一个按键的事儿。
+```
+
+相信你对obsidian了解加深后，很快就会发现这种基于本地文件的数据管理方式有一个弊端，就是太碎片化了。虽然我们在笔记中各种双链引用，玩得不亦乐乎。但是当你导师要求你移交所有项目相关资料给他时，你绝对会傻眼的。
+
+为了方便，我们希望能够在一个 vault 库中放所有的内容。生活日记和工作日志，文献笔记和实验记录各种混淆在一起。你不可能把整个 vault 压缩了发送给别人。这不仅过于笨重，而且还会泄露隐私。
+
+不过好在，本教程中模板库将项目统一放到 03-Projects 的子目录中，在一定程度上实现了「写日志」、「读文献」和做其它课题项目的物理分隔。在此基础上，你可以**打开想要导出的项目文件夹中任意一个页面，然后执行 `quickAdd: 📦导出项目` 命令**，即可导出项目的笔记和附件，还有被直接双链引用的页面到用户桌面。
+
+所以千万不要在草稿事务中引用你的每日日志，否则这些涉及隐私的日志文件也会被导出。
+
+为了方便，与项目一起被导出的还有本模板库所必需的一些文件。你可以把这个当作是一个新的 obsidian vault给人使用。当然了，你可以先打开这个新的库check一下内容是否正确显示，附件文件是否遗失，以及涉及隐私的内容被错误导出等等。
+
+而对于项目涉及的原始数据部分，在[[规范的实验记录#^yapxwe]]中我们已经提到，由于数据量大，一般不作为附件存入库中，只是会插入其文件路径。所以你可以把移动硬盘移交并提示导师修改硬盘盘符为你自定义的`Y`，以支持从 obsidian 笔记到原始数据的正确跳转。
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+到这里，obsidian_vault_template_for_researcher 提供的三种 workflow 基本介绍完毕。
+```
+
+---
+
+page:: 24
@@ -0,0 +1,63 @@
+---
+title: 工作小结与周汇报
+date: 2022-03-28 20:29:26
+excerpt: 梳理和总结工作有助于提高效率。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+这部分内容很多前面已经提过，所以主要是增加对制作任务甘特图的说明。
+```
+
+### 在幻灯片中总结工作
+
+虽然文献阅读周小结我建议单独新建页面进行撰写（详见[[../2-obsidian读文献/阶段性文献阅读小结]]），但是工作小结方面的内容还是推荐并入[[../1-obsidian入门/每周定期汇总小结]]中。
+
+由于周小结往往需要进行幻灯片展示给他人，所以可以从周小结页面通过双链再新建一个幻灯片页面来进一步汇总整理本周完成的课题相关的事务。如何制作 obsidian 的幻灯片其实也在第一章就介绍过了（详见[[../1-obsidian入门/在obsidian中写幻灯片]]）。
+
+
+### 从看板的归档任务创建甘特图
+
+你可以在周小结页面，通过 `quickAdd: 🐸任务存档` 来一键完成本周项目任务的看板流程。
+
+它会根据[[任务看板]]中已经归档的内容（参考[[新建课题项目#利用看板管理任务]]），生成一个甘特图，从而直观显示本周你在课题项目中的事务进展。示例如下方。
+
+```mermaid
+gantt
+title 本周项目事务甘特图
+dateFormat YYYY-MM-DD HH:mm:ss
+axisFormat %m-%d
+section obsidian
+这是一个测试 :t1, 2022-03-28 14:32:45, 2d 10min
+section 测试
+做饭 :t2, 2022-03-29 14:32:45, 3d 30min
+洗碗 :t3, 2022-03-30 16:32:45, 1d 30min
+```
+
+你当然可以把这段甘特图代码拷贝到工作汇报的obsidian幻灯片中，它在幻灯片中也是能够正常显示的。
+
+注意此命令并不会帮你删除看板中已归档的内容。因此会逐渐累积过去所有已归档的内容制作甘特图。如果你只想显示一周内的。你可以定期每周制作完甘特图之后，删除已归档卡片内容。
+
+### 归档记录并查看概览
+
+前面我们已经再三提醒，草稿的 front-matter 部分的 destination 相对路径信息要填写正确。这样才可以对所有 `01-Diary/本周事务` 中的草稿使用`QuickAdd: 📒草稿归档` 命令以自动归档。
+
+![[Pasted image 20220329092656.png]]
+
+正确归档后，你可以按住 Ctrl，click该项目的子文件夹查看其overview（参考[[新建课题项目#项目概览]]），如上图所示，你可以很直观地以卡片的方式（卡片会抓取笔记中图片和文字作为内容摘要）查看每一次的实验记录。
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+关键性的实验结果拿到以后，一般这个课题就可以开始动手撰写论文草稿了。
+```
+
+---
+
+page:: 22
@@ -0,0 +1,80 @@
+---
+title: 撰写论文草稿
+date: 2022-03-29 09:01:36
+excerpt: 你以为的论文初稿在我这都算是终稿了。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+这一节内容涉及到的操作很多前面都提到过，主要是复习下「版本控制」的思路和操作。
+```
+
+### 复制粘贴完成初稿撰写
+
+当实验记录和有效实验结果积累到一定程度，课题的核心目标或者猜想得到验证后，便可形成一个初步的草稿。
+
+撰写论文草稿与撰写实验记录一样，走「看板流程」，然后归档到课题项目的`文章草稿`子目录中。
+
+不过撰写论文草稿可以使用[[论文草稿模板]]，已经按照论文主题划分好了 Title，Abstract，Introduction，Results and Discussion，Conclusion 几个部分。
+
+一般大家可能认为初稿起码要达到段落语句通顺，图表大体完成。
+
+事实上在我提供的流程中，这还远着呢！
+
+最原始的初稿就是实验记录和实验结果以及更前期文献调研报告的拼凑。
+
+所以形成第一步初稿只是一个资料整理的工作。你也不要着急换成英文写。
+
+在前期文献调研的时候，就可以填充 Introduction 部分。
+
+而有效的实验结果整理好后，可以把文本内容直接复制过来。
+
+所以你看，前期做好了整理，到形成文章初稿主要是复制粘贴的工作。
+
+这个初稿可以说是非常粗糙的东西，但是包含了基本的信息，但这就已经足够了。
+
+另外为了跟导师沟通交流方便，你也可以另外制作幻灯片。不过幻灯片就没有那么多细节和废话了。
+
+### 初稿迭代与版本控制
+
+得到了我上面所述的第一版初稿，第二版初稿再往后就是要不断迭代。
+
+类似于[[整理实验方法]]中提到的**版本控制**策略，你可以使用「嵌入引用」的方式在第二版初稿中插入第一版的内容，作为 History。
+
+![[整理实验方法#创建和撰写protocol整理页面]]
+
+为了编辑和预览同步，你可以点击第二版草稿页面的「更多选项」，选择「上下拆分」或者「左右拆分」。再对新拆分出来的相同的panel开启预览，然后再点击原页面的「更多选项」，进一步点击「与其它面板关联」，最后选中开启预览的面板。
+
+![[Pasted image 20220329095309.png]]
+
+这样做的好处，就是你可以一直看着之前版本的内容，在新版本中进行内容修改迭代。然后使用 quickAdd 命令导出为 word 文档的时候并不会插入这些被嵌入引用的历史版本的内容。
+
+### 论文中插入参考文献
+
+参考[[../2-obsidian读文献/阶段性文献阅读小结#如何插入参考文献]]。注意如果是一句话引用多篇文献，citation key 的双链引用直接用空格隔开即可。
+
+### 论文草稿导出为word
+
+参考[[规范的实验记录#导出已完成实验记录为word文档]]，注意导出的 word 文档中 bibliography 默认是 acs-nano 的格式。作为论文草稿它其实足够用了，自带DOI链接，可以随时查看原文链接。
+
+现在很多杂志还是接收 word 版本的投稿，所以很多老师也习惯于用 word。然后你希望你的老师帮你改文章的话，最好提供给他们这个 word 文档。
+
+另外自定义导出功能还会把引用了的文献打包导出为 **refs.bib** 文件，会用 latex 的童鞋也可以方便地使用这个子文献库文件，进行后续的论文写作排版。
+
+不过话说回来，写论文从来都是先把内容搞定，最后再调整格式排版。当**论文内容上已经完成不再做修改的时候，我们这个初稿才算是迭代完成**。
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+一般说来，论文发完，整个课题项目的所有资料就可以进行导出存档操作了。
+```
+
+---
+
+page:: 23
@@ -0,0 +1,66 @@
+---
+title: 整理实验方法
+date: 2022-03-28 18:35:17
+excerpt: 整理好的实验方法是一种宝贵的积累。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+整理实验方法其实非常简单，主要是借此谈一谈obsidian的嵌入引用功能
+```
+
+### obsidian嵌入引用
+
+相信前边已经注意到大量的双链引用，如 `[[something]]`，还有插图如 `![[image.png]]`。前者通常指向某个页面或者附件文件，后者多了一个感叹号之后就实现了嵌入，即在当前页面显示链接文件的内容。这就叫嵌入引用了。
+
+当然了，嵌入引用能够显示其内容的文件类型非常有限，仅包括图片文件，如 png、jpg、gif 格式的。而音频文件我只测试过 mp3，视频文件仅测试过 mp4，这些多媒体文件也可以正常显示。另外还可以嵌入显示 pdf 文件。这么多文件可以嵌入显示，显示其它笔记页面的内容自然不在话下。比如：
+
+![[规范的实验记录#分享嵌入视频的实验记录]]
+
+上边的嵌入引用就可以在预览模式中显示存在于[[规范的实验记录]]中的内容。由于创建双链是obsidian最基础的功能之一，所以在输入的时候有很多补全提示，如下图所示：
+
+![[Pasted image 20220328184354.png]]
+
+嵌入引用别的笔记中的内容，可以尽可能地复用一些东西，减少重复性的工作，同时也可以通过这种方式建立多个笔记之间的相互链接引用关系，是一举多得。关于双链引用还有很多种玩法。但是我**建议初学者仅在整理实验方法或者整理主要的实验结果上使用**。
+
+### 创建和撰写protocol整理页面
+
+同[[规范的实验记录#从看板创建实验记录草稿]]，建议你也从看板创建 protocol整理页面。
+
+![[Pasted image 20220328185811.png]]
+
+在protocol整理页面中，注意在 front-matter 中添加 `#protocol` 专属标签。这样你以后就可以通过标签搜索快速找到文库中所有的整理好的实验方法。
+
+如上图所示，借鉴了 git 做版本控制的思路，其实主体内容仅包括两大部分：
+
+1. Master，也就是最新修订版本，建议使用列表完整地撰写。你可以在下次做实验直接**将此部分文字复制到新实验记录中**。
+2. History，也就是历史版本，当实验不顺利需要对具体方法步骤做调整（在实验记录中），可以通过嵌入引用的方式指向被修改的地方，并作必要说明。
+
+obsidian 不仅仅可以嵌入引用整段标题作用范围内的内容，也可以具体引用某一行的文字。
+
+你只需要右键单击此行，会出现一个右键菜单，你再点击`copy block embeded`，就可以把这一行的嵌入引用的对应文本，形如`![[some_page^ei2fi3]]`的内容复制到粘贴板，然后在其它页面粘贴一下，就使用了对这一行文本的嵌入引用。
+
+实验结果和实验方法类似，都不是一次就能搞定的。所以都可以采取这种「版本控制」方式进行整理，就不再复述了。不过作为实验结果整理页面，你同样可以加上专属标签如 `#results` 。如果实验结果涉及比较繁重的数据分析过程和方法，比如要写代码，你可以考虑使用本教程提供的[[代码整理模板]]。
+
+### 导出和分享protocol
+
+一份稳定了好用的 protocol 当然是值得打印出来的（随时随地可以查看）。你可以直接使用 obsidian 的导出 pdf 功能，它会根据你使用的主题样式生成排版好的 pdf 文件，然后打印出来。值得注意的是，**嵌入引用的内容同样会被打印出来**，其它各种插件和代码块（如admonition、mermaid、excalidraw）的样式效果都会被正确渲染。
+
+如果你希望导出 word 版本做更简洁更正式的终版编辑，可以参考[[规范的实验记录#导出已完成实验记录为word文档]]，此时嵌入引用的 History 内容将不会显示。
+
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+做实验不仅仅是记录和方法，还需要跟很多具体的实物打交道，比如试剂、耗材、仪器等等。这些实物的信息同样是我们需要记录和在写论文的时候的提供的。所以我们也可以在obsidian中对这些实物的信息进行建卡管理。
+```
+
+---
+
+page:: 20
@@ -0,0 +1,74 @@
+---
+title: 新建课题项目
+date: 2022-03-28 10:42:38
+excerpt: 主要涉及FolderNote和看板插件的使用
+tags: []
+rating: ⭐⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+与写日志、读文献不同，用obsidian做课题项目将会使用另外一套流程，主要涉及到[[任务看板]]的使用。
+```
+
+
+### 项目文件目录说明
+
+对于任意一个项目，你可以在`03-Projects`目录下新建一个文件夹，并使用项目名称或者关键词命名。
+
+此处为基础研究课题项目为例，一般一个课题项目会以论文发表为阶段性终点。而一篇论文背后主要包括：
+
+- 实验记录：主要是实验操作，试剂耗材仪器设备使用和原始结果的记录
+- 结果汇总：主要是有效原始数据处理和讨论分析此类内容的整理汇总
+- 论文草稿：根据课题立项依据、有效实验结果进一步组织的论文草稿相关内容
+- 经验汇总：项目进行中结合实践经验和参考资料整理形成的protocol，包括做实验也包括数据分析处理和可视化作图
+
+所以可以在项目文件夹内再新建上述四个 folder。如果是其它类型的项目，你可以根据自己的需求做好顶层设计，方便后续项目资料记录的分类整理。
+
+### 项目概览
+
+![[Pasted image 20220328110943.png]]
+
+如上图所示，本教程提供的模板库内置了 Folder Note 插件，你可以按住 Ctrl 点击左侧的项目文件夹打开概览页面。在预览模式下可以卡片形式显示。同理，你也可以对诸如 `1-实验记录` 这类子文件夹，使用 Ctrl + Click 的方式查看概览页面。（具体参见）
+
+![[Pasted image 20220329090857.png]]
+
+文件夹笔记概览用到的代码如上，注意默认新建的文件夹概览页面 noteOnly选项为 true，是不会显示子目录 folder的。然后 style 也还有另外一个选择为 strip。
+
+注意文件夹都只是用于分类收纳的。所以我们新建的草稿，先是自动存储在`01-Diary/每周事务`中，草稿完成后按照 front-matter 中 destination 的相对路径，被转移到指定的目录内。
+
+除了插件自动生成的内容（card or strip），Folder Note 页面有多种使用方式：
+
+1. 如果是很有逻辑的创作类项目，将其作为大纲页面，先预填写章节的标题，然后慢慢填坑，就像我在[[README#黑曜石玩家指南书籍目录]]中做的一样。
+2. 如果是实验记录之类的普通项目，可按`Alt+E`插入[[文件夹目录模板]]，可以显示文件夹内所有笔记的标签云和笔记摘要等信息，注意此时笔记是按照创建日期进行排序的。
+
+
+### 利用看板管理任务
+
+![[Pasted image 20220328143508.png]]
+
+一个项目比如是分割成许多任务逐步完成的。对于课题项目中的任务，我建议你使用[[任务看板]]进行管理。你可以` Ctrl+Q` 打开 `quickAdd 面板`，点击 `🐮新建任务`。
+
+在 New Task 的弹出输入框中，建议你先输入一个或若干个专属标签，如`#obsidian搞科研`，然后空格，再输入具体的任务名称，注意尽量简短。回车确认后，你就可以在 `00-MOC` 目录下的 [[任务看板]] 页面中看到该任务卡。如果已经开始执行，你可以把它拖拽到 Doing 面板中。
+
+![[Pasted image 20220328144201.png]]
+
+如果任务已经完成，再将该任务卡拖拽到 Done 面板中，并**及时**点击 Archive card，给该任务添加上完成时间戳。
+
+![[Pasted image 20220328144443.png]]
+
+将任务看板打开为 markdown 文件你可以看到，在归档下边，已经完成的任务包含了完整的起始时间戳。这个时间戳很重要，后面我们进行周小结的时候可以利用归档信息绘制甘特图（参考[[工作小结与周汇报#从看板的归档任务创建甘特图]]），那么就可以一目了然地看到一周内项目的具体进展。
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+在一个课题项目的执行中，首当其冲就是做实验，而写好一份实验记录就非常重要了。
+```
+
+---
+
+page:: 18
@@ -0,0 +1,42 @@
+---
+title: 本章小结-祝您科研精进
+date: 2022-03-29 10:39:18
+excerpt: 教你技术不是让你内卷的。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+本来我是想给这章的小结起一个轻松的名字，比如「祝您文章大发」。但又觉得土里土气的，毕竟文章嘛，只是身外之物。所以我就给改了下，换成了「科研」。这科研就包罗了更多东西，比如思辨能力和学术品味的提升。
+
+搞研究，说实话，成果多少是可以做出来的，所以文章无论怎样也是可以发的，这是一个确定性的事情。但是要做真正创新的突破性的成果，发好的文章，多少有些运气在里边，这是一个不确定性的事情。所以我只能用「祝」这个动词，表示「祝你好运」。
+
+因为即便你很好地利用了 obsidian 这个工具，采纳了我提及的 workflow，能否真正在学术道路上取得较大的成就，这也是无法保证的。就像坚持跑步能增加耐力，**参考本教程能带给你的确定性，只是信息高效管理这种技能的进步和提升**，仅此而已。
+
+我留意到近些年选择读研的同学越来越多。即便知乎上劝退文再多也无法阻挡这种趋势。生化环材都说是天坑但是入坑的同学同样络绎不绝。或许，很多人可能觉得没得选择吧。虽然读研没钱，但好歹还能弄个学位，如果用功一点还能学点真本事。每个人心中都有自己的小账本。
+
+我也留意到大家越来越感叹学术圈之内卷。学历贬值是一日快过一日，更不用说被称之为「硬通货」的发表文章成果。早几年一篇顶刊能直接给副教授的年代早已一去不复返，多少青年才俊过去是望「洋」兴叹，现在是望「家」兴叹。
+
+我还注意到一些诸如「图片误用」或「符合当年标准」的学术圈丑怪现象。这些情况或许可以归咎于当时的条件限制，比如没有像我提供的这类科研工作规范流程与工具链。但归根揭底还是因为知识壁垒太高，没有足够多的局外人去关注这个群体，然后正确客观地评价科学家们的工作。缺少实质意义的阳光和透明，所以同行评议慢慢演变成了圈子文化，固步自封而已。
+
+虽然当前情况不妙，但总的来说，我觉得**对于个人而言，研究生还是值得一读的**。因为研究生更像是职场，但与职场不同的是，你是可以在科学探索中犯错而不用承担特别大的代价（除了安全事故和违反学术道德之类严重的情况），相对宽松的环境会给你足够的成长空间和思考未来的空间。
+
+我想强调的是，**即便读研到博士毕业，也不要轻易觉得自己应该或者适合继续去做学术研究**。博士之后的学术研究是职业范畴，跟做其它项目是类似的。你应该认真考虑自己真正想从事的事业，那种到临终之时不会后悔的事情。而且经过了研究生阶段的训练，你也应当有这个自信——干什么都不会混得太差。
+
+所以我觉得还是应该将自己的体会和经验分享出去，让新加入的研究生大军，能够相对规范且高效地成长起来，哪怕以后不能成为教授学者，凭借多年的科研训练和形成的缜密思维和学术鉴赏力，也能够作为一个合格的旁观者，关注和评议科学成果，帮助学术圈在阳光下健康成长。这样形成的真正的科技繁荣的局面，于你于我，于全世界普通人都是一件幸事。
+
+扯远了。回到本教程来说，前期我只是疯狂描述该怎么操作工具以完成三种基础的 workflow。这是为了降低 obsidian 的使用难度，让普通用户能够以尽可能低的学习成本去完成足够多的事情。
+
+但是作为笔记软件，一千个用户就有有一千种 obsidian。用户越发熟悉使用之后（比如用上半年之后？），总归要根据自己的实际情况做出调整，这就不可避免地需要进一步了解实现各种便捷功能的插件和底层代码。
+
+本来我还想就此做一些说明，但其实相关插件教程网上导出可以轻松找到，而python代码对于会的同学来说也很简单，可以直接看代码而无需我做太多解释。再加上对于绝大部分普通用户，三大 workflow 其实是足够用的。**最重要的是自己做了修改之后，就不能应用我最新的模板库升级了**。
+
+所以本模板库教程，就到此为止了，最后再次祝您，科研精进！
+
+---
+
+page:: 25
@@ -0,0 +1,108 @@
+---
+title: 规范的实验记录
+date: 2022-03-28 15:18:43
+excerpt: 撰写实验记录可以说是基本功了。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+本节内容主要涉及实验记录的创建，撰写和自定义导出为word文稿并打印等内容。
+```
+
+### 从看板创建实验记录草稿
+
+![[Pasted image 20220328160854.png]]
+
+在obsidian做课题的工作流程中，有些任务相对比较复杂，不是任务看板中一句话就能说清楚的。比如做某某实验，这个时候我们可以右键点击该任务卡片，选择从卡片新建笔记。
+
+该动作会以[[草稿模板]]自动在 `01-Diary/本周事务` 中生成以该任务名为文件名的草稿。
+
+请务必采取上述看板流程创建实验记录（而不是从日志的Tracking中直接新建任务类草稿），其它任务相关的笔记草稿都是如此。
+
+### 插入实验记录模板
+
+![[Pasted image 20220328161147.png]]
+
+创建好的草稿你需要补充完成 front-matter 的信息，具体参考[[../1-obsidian入门/obsidian撰写草稿#front-matter]]。然后你可以使用 templater 插入[[实验记录模板]]，操作方法可参考[[../2-obsidian读文献/解析文章骨架#插入文章骨架模板]]。
+
+
+### 实验记录结构说明
+
+![[Pasted image 20220328162959.png]]
+
+如上图所示，实验记录一般可以分为五个部分：
+
+1. 目的和预期：为什么要做这个实验，要解决什么问题，有什么预期（假设）？
+2. 方案设计：实验组和对照组，控制的变量是什么，观察什么指标，如何验证假设预期？
+3. 材料仪器准备：根据实验方案和实验步骤确定，提前准备和预约。
+4. 实验步骤：具体的实验步骤，按顺序一条一条写，或者使用表格。
+5. 结果和分析：简单比较实验组和对照的初步原始结果，理解所控制的变量和实验观测指标的关系，检验前面的实验预期，得出有效结论。
+
+其中前四个部分都可以在真正做实验之前撰写完毕，然后导出为 pdf 并打印出来（可参考[[../2-obsidian读文献/阶段性文献阅读小结#导出文献阅读小结为pdf]]）。拿着这个去做实验，如果有什么临时变化可以标记修改。做完实验拿到数据之后再填充第五部分。
+
+```ad-tip
+在材料仪器准备方面，你完全实现对每一种材料试剂，仪器设备单独建立信息页面，然后在实验记录中直接创建双链引用即可。详细内容可参考后面章节👉[[试剂耗材仪器信息管理]]
+```
+
+```ad-tip
+title: 插入路径
+
+虽然obsidian可以通过拖拽的方式把任意类型的文件转存到 08-Assets 目录，并将双链引用插入到笔记中，但是我并不建议你把原始数据（通常比较庞大）直接弄到文库里，这样会变得非常 heavy。这种情况下你可以用一个大容量硬盘，设置其盘符为不常用的 `Y` 之类的。然后通过 `quickAdd: 📂插入路径` 的方式，然后将数据所在路径拷贝到Enter value输入框中，创建指向实验数据所在文件夹的超链接。
+```
+^yapxwe
+
+%%注意不要在Admonition中插入图片，否则使用 clear unused images 将会清除此类图片%%
+
+### 导出已完成实验记录为word文档
+
+实验记录是科研项目中重要的存档资料，过去很多情况是直接在纸质实验记录本上誊写的。但显然电子实验记录比纸质记录有着太多优势：
+
+- **书写速度快**，打字速度一般能到160字/分钟，更不用说可以复制粘贴
+- **容易搜索相关信息**，如果要查阅过去的电子实验记录内容非常简单，而纸质记录要翻找半天
+- **简洁高效的排版**，使用本教程书写实验记录只需专注于内容，无需在意格式排版也能得到整洁美观的打印版本
+
+也有人担心电子记录容易被篡改。事实上你可以将课题项目的整个 folder 单独使用 git 进行管理。每一处文本修改都会自动生成记录。
+
+当然现在仍然有很多老一辈的科研人并不懂也不愿意接受这些新鲜事物，所以请你务必征求导师同意后，每周定期将电子实验记录导出并打印为纸质版，装订好让导师签名并附上日期。
+
+obsidian 并没有提供直接导出 word 文档的功能。但是在本教程提供的工作流中，pandoc 工具可以完成该功能（详见[[../1-obsidian入门/软件下载安装#pandoc 安装与配置]]）。具体操作上，你只需要执行 `quickAdd: 👑导出笔记` 命令即可。
+
+![[Pasted image 20220328165705.png]]
+
+执行该命令后，会将笔记导出到用户桌面的 `obsidian-export` 目录。笔记机器相关文件将存放于同文件名目录下。在此目录下生产的文件如上图所示。
+
+![[Pasted image 20220328170018.png]]
+
+可以看到，word 文档中的提供了实验的标题和实验记录的创建日期。但是图片都是全宽显示，可能导致页面存在大量空白，所以你可以进一步对 word 文档中的图片大小进行调整（按住shift使用鼠标进行拖拽实现等比例缩放），最后双面打印出来。
+
+
+### 分享嵌入视频的实验记录
+
+在 obsidian 中撰写笔记，你可以随意地插入多种多媒体资源，比如音频、视频、动图。在 obsidian 预览页面中它们都可以正常的显示和播放。但是导出为 word 文档后多半是无法正常显示的。
+
+可是有些时候，我们希望给导师看视频结果（且包含详细上下文描述）。为了满足这个需求，`quickAdd: 👑导出笔记` 命令还可以生成可断网独立访问的 html 文件，将多媒体文件数据嵌入到页面中。所以你可以将上一步导出实验记录产生的后缀为 `.html` 的网页文件发送给他。经过测试，手机（微信）上是可以直接打开 html 的。但是千万不要嵌入过大的视频文件（建议小于30M）。
+
+
+### 使用自定义导出笔记功能的重要说明
+
+obsidian 可以使用双链内的声明，如`![[image.png|300]]`，实现图像显示大小的调整。由于代码开发暂不完善，自定义导出笔记功能暂时不支持对此类情况的解析。所以对于**需要导出为word的笔记，请不要在obsidian中调整图片的大小**。
+
+笔记中插入了参考文献时（参考[[../2-obsidian读文献/阶段性文献阅读小结#如何插入参考文献]]），**自定义导出笔记时会生成 bibliography 需要联网**，否则会报错导致无法实现格式转换。
+
+自定义的 `quickAdd: 👑导出笔记` 功能尚不完善，且涉及诸多文件和路径，还依赖于 pandoc 实现从markdown 格式到 docx 和 html 的转换。所以如果这两种格式的文件并未生成，请从 command-docx.txt 或者 command-html.txt 拷贝对应的命令，在导出目录下新建 terminal（cmd）运行查看报错信息。
+
+```ad-info
+title: 下节预告
+刚开始做实验，我们会自然地希望尽快掌握实验方法技巧。一个好的实验室一般都会流传着好用实用的protocol。这个在某种意义上是实验室真正的积累，因为篇幅有限，发表论文上的methods大多省略了太多细节。而决定成败的往往就是细节。所以下节内容将详细讨论如何形成protocol积累。
+```
+
+---
+
+page:: 19
@@ -0,0 +1,85 @@
+---
+title: 试剂耗材仪器建卡管理
+date: 2022-03-28 19:29:08
+excerpt: 没想到obsidian也可以用于管理试剂库存。
+tags: []
+rating: ⭐
+status: complete
+destination: 03-Projects/黑曜石玩家指南
+share: false
+created: 2025-08-30T11:45
+updated: 2025-09-22T13:27
+---
+
+```ad-info
+title: 友情提示
+此节内容主要涉及 obsidian制作卡片相关的流程，又稍有不同。
+```
+
+### 创建卡片
+
+![[Pasted image 20220328194441.png]]
+
+在obsidian界面左侧边栏中，你可以找到「创建新的 ZK 卡片」的按键，点击后会自动在 `06-Cards` 目录中生成卡片，并跳转到新建卡片页面。
+
+![[Pasted image 20220328194629.png]]
+
+在编辑模式可以看到，卡片的文件名是自动按照时间戳进行编码的。然后根据[[卡片模板]]生成的 front-matter 信息也非常简单：
+
+1. alias：这里你可以填写试剂耗材的简短别名，比如用 DMSO 代替二甲基亚砜。这样你后面在实验记录中如果要使用双链引用这个试剂，可以通过别称从文本补全列表中快速找到此试剂。否则通过记住这个时间戳文件名就太难为人了。
+2. tags：卡片标签，多个标签用空格隔开。有了标签，我们可以比较轻松地实现卡片信息地分类检索。所以你可以在这里把标签当作分类来用。比如是试剂就用试剂库存作为标签。是仪器设备类的卡片就用仪器设备做标签。
+
+### 插入试剂模板
+
+如果这是一张试剂卡片，你可以用 Templater 插入本模板库中已经提供的 [[试剂卡片]] 模板。进一步快速填写卡片内容。
+
+![[Pasted image 20220328195307.png]]
+
+如上图所示，我采取了 dataview 所能识别的 `key:: value` 的方式来组织卡片信息，其好处就是后面可以在 `00-MOC` 中使用一个页面 [[试剂库存管理]] 直接对所有的试剂卡片做 query。
+
+对于一个试剂类的卡片而言，比较重要的信息不外乎：
+
+- 名称
+- 存放位置
+- 类别
+- 余量
+- 规格
+
+你当然可以根据自己的情况和喜好进行增减。除了补全上述信息方便 dataview query之外。为了方便，建议可以从购买的网址链接直接截图贴在卡片中（附件区域）。
+
+此外，试剂的购买报销也是有一套流程要走，多弄几次也可以整理成一个 protocol（参考[[整理实验方法]]）。然后这个流程中产生的一些重要的文件，比如什么表格文件，什么订单截图，发票，试剂盒说明书等等附件，你都可以直接用拖拽的方式插入到这个卡片中。它们会被自动转存到 `08-Assets` 目录下。
+
+仪器设备的话，不仅要记录名称型号，可能还有使用培训的一些笔记。你可以参考试剂卡片，自行涉及仪器卡片的模板。
+
+### 试剂库存的查询管理
+
+![[Pasted image 20220328200413.png]]
+
+ 请直接到`00-MOC` 目录中，打开页面 [[试剂库存管理]] 并预览，便能查看 `06-Cards` 中试剂类卡片的信息。这段 dataview 的 query 代码如下：
+ 
+ ![[Pasted image 20220328200535.png]]
+ 
+ 当你修改了卡片模板之后，可以在这段 query 中修改对应的键。
+ 
+ ![[Pasted image 20220328200749.png]]
+ 
+ 如果列表太长，你可以直接在预览模式下按快捷键，Ctrl+F，输入关键词搜索，入上图所示，结果会被框选。
+ 
+ 总而言之，这并不是一个成熟的试剂库存管理方案，但对于个人来说其实足够用了。最重要的是这些资料就以卡片的形式存放于你的库中，你无论是写实验记录还是写论文草稿，都可以快速地引用它。如[[202112201648|Avidin]]
+ 
+ ![[Pasted image 20220328201143.png]]
+ 
+ 而这个时候你也应该知道，在obsidian中被双链引用的内容，如果不是嵌入引用，按住 Ctrl，用鼠标悬停于引用上方是可以预览的。
+ 
+ ![[Pasted image 20220328201208.png]]
+ 
+ **That's pretty good!**
+ 
+ ```ad-info
+ title: 下节预告
+ 一周之内，看看文献，做做实验，买买试剂，学学仪器，科研工作大体就是这样。很快就到小组会时间了，你该写一下工作总结了，这该如何是好？
+ ```
+
+---
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+page:: 21